Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms