Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx6Q9ER75 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx6Q9ER75 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms