Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx12Q9ER00 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx12Q9ER00 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms