Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm5Q9D806 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm5Q9D806 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms