Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znhit3Q9CQK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znhit3Q9CQK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms