Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp4Q99ME9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms