Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnps1Q99M28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnps1Q99M28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms