Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Commd9Q8K2Q0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Commd9Q8K2Q0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Commd9Q8K2Q0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.2 ms