Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
6820408C15RikQ8BJX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
6820408C15RikQ8BJX2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms