Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med16Q6PGF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms