Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smchd1Q6P5D8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smchd1Q6P5D8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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