Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms