Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SrmsQ62270 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrmsQ62270 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SrmsQ62270 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SrmsQ62270 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SrmsQ62270 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SrmsQ62270 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SrmsQ62270 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrmsQ62270 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms