Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mre11Q61216 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms