Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms