Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam228bQ497Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam228bQ497Q6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms