Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bop1P97452 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms