Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmod1P49813 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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