Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GastP48757 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GastP48757 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GastP48757 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GastP48757 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GastP48757 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GastP48757 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GastP48757 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GastP48757 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms