Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox2P48432 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox2P48432 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms