Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epb41P48193 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms