Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TfamP40630 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TfamP40630 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TfamP40630 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TfamP40630 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TfamP40630 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TfamP40630 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms