Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga1P29974 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms