Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P18525 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P18525 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18525 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18525 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P18525 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P18525 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18525 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18525 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P18525 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18525 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms