Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhoP15409 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhoP15409 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhoP15409 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RhoP15409 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RhoP15409 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RhoP15409 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms