Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prf1P10820 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prf1P10820 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms