Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms