Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rabep1O35551 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabep1O35551 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms