Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rnf5O35445 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rnf5O35445 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf5O35445 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf5O35445 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf5O35445 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf5O35445 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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