Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm8444F6XS56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm8444F6XS56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms