Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trappc8E9PWG2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trappc8E9PWG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc8E9PWG2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms