Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd60A2AMD2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd60A2AMD2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms