Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms