Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Trpc3Q9QZC1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trpc3Q9QZC1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trpc3Q9QZC1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trpc3Q9QZC1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trpc3Q9QZC1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trpc3Q9QZC1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc3Q9QZC1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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