Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan11Q9D1D1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms