Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sntg1Q925E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms