Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC23

Uncharacterized protein C11orf86 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VC23 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VC23 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VC23 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VC23 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VC23 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VC23 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VC23 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VC23 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VC23 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms