Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik4Q8BMF5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik4Q8BMF5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms