Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptx4Q6RUU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms