Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2surpQ6NV83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2surpQ6NV83 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms