Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms