Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mre11Q61216 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mre11Q61216 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms