Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clns1aQ61189 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms