Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
WhammQ571B6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WhammQ571B6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms