Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm6Q3UZD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm6Q3UZD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms