Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmod2Q3UHZ5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms