Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms