Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ulk3Q3U3Q1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ulk3Q3U3Q1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms