Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q08AU9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q08AU9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q08AU9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q08AU9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q08AU9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q08AU9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms