Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MitfQ08874 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms